E persone è i pumati venenu in diverse forme è dimensioni. Hè perchè ogni individuu hà un inseme unicu di variazioni genetiche - mutazioni - chì affettanu cumu agiscenu è funzionanu i geni. Inseme, milioni di picculi variazioni genetiche facenu difficiule di predichendu cumu una mutazione particulare avarà un impattu in ogni individuu. Cold Spring Harbour Laboratory (CSHL) Prufissore è Howard Hughes Medical Institute Investigator Zach Lippman hà dimustratu cumu e variazioni genetiche in i pumati ponu influenzà a manera chì una mutazione specifica afecta a pianta. Hè travagliatu per pudè predichendu l'effetti di e mutazioni nantu à e diverse varietà di tomate.
Diversi cumminzioni di mutazioni ponu influenzà a dimensione di i pumati in modu imprevisible. In questa maghjina, a prima colonna mostra un tomate senza mutazione (WT). A seconda è a terza colonna mostranu i pumati cù una sola mutazione in una regione di u promotore (R1 o R4) per u genu di taglia di fruttu SlCV3. E mutazioni individuali anu pocu effettu nantu à a taglia di frutti. Ma a cumminazzioni di sti dui mutazioni (R1 + R4) rende un fruttu assai più grande.
In questu studiu, Lippman è a so squadra anu utilizatu CRISPR, un strumentu d'editazione di geni assai precisu è miratu, nantu à dui geni di tomate chì cuntrolanu a taglia di fruttu, SlCV3 è SlWUS. Anu generatu più di 60 mutanti di tomate sguassendu picculi pezzi di DNA in e regioni promotore, zoni vicinu à i geni chì cuntrolanu a so espressione. In certi casi, mutazioni individuali anu aumentatu a dimensione di i pumati per un pocu. Certi pariglii di mutazioni ùn anu micca cambiatu a taglia di frutti. Uni pochi cumminzioni sinergichi anu causatu un incrementu drammaticu, imprevisu, di a taglia di frutti. Lippman dice: "U veru Santu Graal in tuttu questu per a ripruduzzione di culturi hè a prevedibilità. Se mi mutate sta sequenza, aghju da ottene stu effettu. Perchè ci hè stu mare di altre varianti chì a natura hà accumulatu vicinu à a mutazione chì site ingegneria, è ancu spargugliati in u genoma, assai di e quali puderanu influenzà a mutazione specifica chì stai creendu ".
Questa gamma di interazzione per ogni dui mutazioni modella e cunsequenze di una sola mutazione chì si trova in diversi sfondi genetichi. L'effettu hè paragunabili à quelli chì si trovanu in certi malatii umani, induve certi persone puderanu avè certe mutazioni pre-esistenti chì li prutege da mutazioni chì causanu malatie.
Lippman è a so squadra cuntinueghjanu à quantificà cumu e mutazioni individuali è cumminate affettanu certi tratti di culturi. Finu a ora, anu misuratu l'interazzione trà duie mutazioni individuali, ma i genomi anu milioni di variazioni. Lippman spera di studià abbastanza interazzioni misurabili per rende l'allevamentu più prevedibile è efficiente.
Pè sapenne di più:
Laboratoriu di Cold Spring Harbour
www.cshl.edu